自從失去了家國，天祥的身上就隨時暗藏了一把匕首，以備在必要時自刎所用。當時元軍佔領了臨安，但兩淮、江南、閩廣等地還未被元軍完全控制和佔領，天祥隨時準備出逃，只要逃的掉，他誓為家國社稷的保全，再度竭智盡忠、死而後已。
當時（1276年）元軍責令南宋朝廷派使去元都送投降書，另派一條囚船押送文天祥。這條囚船從大運河行駛到無錫附近，當地黃埠墩﹙是大運河中的一個小島﹚的百姓得知文天祥在船上，各個撫岸痛哭，長跪囚船，並用石塊投擲官船，痛罵南宋小朝廷認賊作父、為虎作倀。群情洶湧，感動了囚船上的文天祥，他痛哭失聲，於是作詩一首，至於此詩至今還矗立在黃埠墩的一塊巨大的石碑上呢。
就在押送天祥前往元朝京師大都（今北京）的路上，天祥一行人冒著極大的風險真的在鎮江幸運脫身了；當時文天祥的船隻雖馬上被元軍巡船發現，可是巡船追捕時卻因為擱淺無法行動，眼睜睜的看著天祥的船漸行漸遠，這天意要天祥自由，於是開始了他顛沛流離到處打游擊戰的苦戰生涯。
文天祥一行人首先到達了真州（今江蘇儀征市，即揚州市西南），在邊境的真州軍民的熱情歡迎之下，真州的昔日同僚卻認為天祥已是降元的奸細，要擒拿他就地正法，這邊境的守將苗再成進退兩難，只好忍心把文天祥騙到城外強驅離開。無奈何悲憤的天祥只好乘黑夜通過元軍控制的地界，到達了揚州城下。然而此處的宋軍已經明令要捉拿天祥，所以更是走投無路，盤查嚴密，形勢緊張，他們流離無方，既要躲避元軍，又要躲避宋軍。文天祥於是決定離開揚州，去尋找更南方的二王行在﹙即益王趙罡和衞王趙昺﹚，再為朝廷效力。
從揚州到高郵，文天祥一路顛沛流離，饑寒交迫。說巧不巧，當他們走到桂公塘（距揚州約十五里的小村莊）時，竟然又遇上了當時押解他們的元兵隊伍的搜尋。幸好天上突然狂風大作，烏雲密布，元軍急著躲雨，當時匆匆而過，竟然沒能發現眼前就在路邊伏著的他們；才僥倖逃脫，好不容易到了高郵，隨從已是逃的逃、死的死，十二人只剩下六個。身心俱疲的天祥因連日疾行雙腿已傷，他咬牙力撐靠一群樵夫挑擔子幫助，才勉強到達高郵的。誰知高郵方面的這些守軍完全中了元軍的反間計，無奈何的天祥還是無法進城，只得再向泰州（今江蘇泰州﹚摸索前進。經過這樣沿路元軍出沒，宋軍抓補，還有強盜搶劫的歷程，德祐二年（1276年）閏三月，九死一生的他終於經過了這兩三個月日夜驚懼、不成人形的逃亡，揚帆入海，回到了南宋最後佔據的地方。
同年景炎元年（1276）五月他輾轉到達了福州，希望能夠挽狂瀾於既倒。端宗仍然拜文天祥為丞相，督師江西。當月端宗﹙即益王趙罡﹚在福州登位，延續國祚，文天祥此時擔任樞密使兼都督諸路軍馬。可是張世傑這個人開始專制朝政，至於前任宰相陳宜中這個人也還在南宋行朝之中左右時局，所以天祥為爭取時效，只好自己以同都督的身分在南劍州（治今福建南平）開府，指揮抗元。
七月，文天祥在南劍州（今福建南平）開督府高舉義旗，招募義軍，以圖復興，因天祥忠堅聲望不墜，很快又組成了一支督府軍。但是，流浪王朝裡的朝臣還是異議不斷，隱患迭現。十月，文天祥開始出兵汀州（今福建長汀），可歎天祥受任於如此敗軍之際，奉命於如此危難之間，無論他如何夙夜憂勤，還是戰鬥失利。在元軍的強勢攻擊下，最後保家衛國的南劍州也落入了敵手，行都福安（即福州）也隨即陷落，南宋小朝廷從此成為海上的流亡政府，名存實亡的南宋眼看已是名實俱亡！@
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