基因解碼定序方法不同 私人賽雷拉(Celera)公司目前處于領先地位
【大紀元2月16日訊】 十二日國際研究聯盟「人類基因組計畫」与私人賽雷拉(Celera)公司共同宣布完成人類完整基因体圖譜,但科學界普遍認為,賽雷拉目前處于領先地位,也有科學家指出,兩組研究團隊所使用的定序方法不同,所以結果還很難說。
据台灣科技网報導,雖然兩大研究團隊同時公布完整的人類基因定序結果,但從兩組人馬分別選擇Nature与Science兩本相互競爭的科學雜志公布研究成果這件事,就可嗅出兩大陣營的較勁意味,不過周一公布人類基因圖譜完整版后,即使是參与「人類基因組計畫」的科學家也承認,現階段賽雷拉的版本确實較佳,但未來人類基因組計畫的版本將更完整,雙方的差异究竟為何令人好奇。
先從雙方的定序方式談起,人類基因組計畫所采用的方式,是把DNA的雙股螺旋結构有系統地切割成分子种株,由各國分別作定序,之后再整合各國研究成果,賽雷拉則是以散彈槍(shot-gun)方式,造成隨机式的短片DNA种株直接定序,得到無數看似雜亂無章的鹼基序列,再拼成整体序列。
對于這兩种方法,曾有人以畫地圖作比喻,認為人類基因組計畫,像是開車在大街小巷探勘,逐步畫出地圖,而賽雷拉則以鳥瞰的方式,從高空拍下數以万計的照片,然后再將之并湊起來,結果相同,孰优孰劣尚無定論。
除了定序方法不同,擁有最先進最快的分析儀器也是賽雷拉在這場競賽中的重要籌碼,賽雷拉的股東PE生物系統集團(P.E. Biosystems Group),為專業的DNA定序儀制造商,免費提供兩百多台DNA定序儀給賽雷拉,而美國康柏電腦公司也提供三百多台最新的電腦協助其資料分析,相較之下,各國公家研究單位的儀器規模就小得多,頂多只有二、三十台定序儀。
此外,賽雷拉不必像人類基因組計畫一樣,將定序資料公布在网路上供人免費使用,卻可上网參考對手研究的最新進展,也加快其定序速度。
与私人机构的彈性与效率相較,性質屬于公家單位的人類基因組似乎略遜一籌,但賽雷拉散彈槍式的定序方法至今未獲得科學家們公開的支持,而資料庫六個月暫不公開的作法也遭人批評,因此,人類基因組計畫仍有机會可扳回一城。
人類基因組計畫進行之初,科學家們曾估計,完成這項工作至少需要十五年的時間和三十億美元的資金,而賽雷拉公司的總裁溫特(J. Craig Venter)卻放話表示,賽雷拉公司只需要三年時間、二億美元資金就可以完成所有的研究工作,此番話激起雙方的較勁態勢,但以全人類的角度來看,兩造競爭可以加速基因研究的進度,不管何方陣營獲胜,都是人類福音。
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