SARS病毒的分子演化

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【大紀元2月23日訊】去年SARS在亞洲各地大流行后,總共奪走了約800條寶貴的生命。在去年2月的高峰期中,每天都有近50個病例診斷出。几個月后,科學家監定出SARS冠狀病毒,并決定了基因組序列。之后的追蹤發現SARS病毒最有可能來自果子狸,可是至今沒有人知道為何它會對人類大開殺戒。

稍早的1月29日,美國出版的國際權威雜志《科學》全文公布了中國SARS病毒分子流行病學研究小組關于SARS冠狀病毒分子進化規律的最新成果。[1]

該小組定序了SARS病毒的基因組序列,利用分子演化學的方法,追溯SARS病毒究竟如何從動物跳到人類身上,讓整個社會人仰馬翻后,并快速地适應人類這宿主。

為了找出原因,該計畫為63條SARS病毒基因組定了序,他們挑出來自22個廣東及2個香港SARS病人的29條分別代表SARS流行病早期、中期及晚期的病毒之序列進行分析。該研究團隊利用分子演化的方法通過不同病毒基因組的比較,追溯病毒在疾病流行時的變化及其傳播的關系。

該研究團隊利用分子時鐘來檢驗SARS的起源,追溯到約2002年的11月中旬,這和當初突然爆發的流行病學資料相吻合。接著他們進一步發現一個現象:SARS病毒在2002年11月中旬到2003年1月底,病毒基因的spike protein(棘蛋白,就是冠狀病毒外圍的那一層蛋白質套膜,這是決定它感染哪种細胞的關鍵)胺基酸序列變化非常快,可是從1月底到3月初,變化就慢許多。從3月初開始,SARS病毒几乎不再變化,意即之后的病人感染到的,几乎是同一個品系的病毒。

這樣的現象,意味著SARS病毒從果子狸跳到人身上時,許多品系自動地進行了許多自我變异實驗,以期形成一种感染人類效率最高的品系,突變完成后,感染人類效率最高的病毒就傳開來了,到了2003年3月初,已經有一個品系可以完全适應人體了,這個品系不僅能在人體內生存,還能更有效地傳播到他人身上。

除了棘蛋白,SARS病毒也自動刪除了其原來基因組中的29個不必要的核甘酸,同時,有些品系還在它的Orf8區域自動刪除了82個不必要的核甘酸。之后,在SARS流行中期的病人體內,甚至可以同時找到兩种核甘酸都刪除的病毒。

在2003年3月中的2個病人身上,甚至還可找到整個Orf8區域共415個核甘酸都刪除的病毒。這意味著病毒在快速地演化并精簡其基因組以感染人類。

同樣地,1月29日在《科學》雜志上也發表一份報告說明SARS病毒至今仍難以檢測,[2]這是否暗預著SARS病毒仍在快速地突變以躲避人類的追查?為著下一次的肆虐做准備?

在中國傳統的中醫理論認為:疾病多為外邪入侵所致。如現代西方醫學認為的「流行性感冒病毒感染」就稱為「風邪」。皇帝內經的《素問,上古天真論》亦有所謂「正气存內,邪不可干」之說。在當前人類無法抵抗下一波SARS病毒肆虐及發展出疫苗時,做一個堂堂正正的好人(正气存內的人)或許不失為一個根本的解決之道。@

參考資料:
1.The Chinese SARS Molecular Epidemiology Consortium, January 29,
2004; 10.1126/science.1092002 (Science Express Reports).
2.A. C. H. Yu, Science, 303, pp. 469-471, 2004(http://www.dajiyuan.com)

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