他说，油价电价就要上涨，他就任后，马上要做的事是照顾弱势族群，因为一个文明是否进步，就是要看是如何对待弱势族群。

健保经费不足时，该怎么办？林芳郁说，健保制度不宜贸然动大刀，要慢慢治疗，如果要贫穷民众多出保费，只会雪上加霜，所以应增加社会福利的经费来源，另一方面，可以提高民众就医时的部分负担费用，他会请专家小组着手规划，用各种方式缩短医疗差距。

日前基层医院抗议资源分配不公，林芳郁认为，三级医疗的分工要像金字塔结构，台湾不需要如此多的医学中心，医学中心应做急重症医疗研究，地区医院及基层诊所要照顾社区民众，区域医院居于中间，现在大者恒大，医学中心不快乐，大医院的医师也忙得要死，这是制度设计不好，需要检讨。

过去卫生署跟产业界是分开的，现任署长侯胜茂订出健康产业的发展方向。林芳郁说，他跟随侯胜茂的脚步，希望台湾有类似美国食品药物管理局 (FDA)的功能，帮助产业育成，例如中央研究的转殖医学与学界的疫苗研发告一段落，在投入生医新药产业时，卫生署可以从旁辅导，把新的东西用在促进国人健康上面。

在食品安全方面，林芳郁表示，食品上市之后才抽验农药等物质残留，总是晚了一步，消费者早就吃下肚了，希望以后能与行政院农业委员会、经济部等相关部会密切合作，加强食品履历制度，从源头管理。

至于他个人最想推动的法案，则是“汉生病 (痲疯)病人补偿条例”，使长期隔绝的院民能得到人道补偿，也对周遭民众及台北县民都有益。